שעוני קוורץ משתמשים בתנודה של גביש קוורץ כדי ליצור זמן, בעוד שעונים מכניים משתמשים במנגנונים מכניים.
עיקרון עבודה שעונים מכניים וקוורץ משתמשים בעקרונות עבודה שונים. שעונים מכניים משתמשים במתח של הקפיץ הראשי כדי להניע מערכת הילוכים, שבתורה מניעה את המחוגים. שעוני קוורץ, לעומת זאת, משתמשים בתנודה של גביש קוורץ כדי ליצור זמן. הם מנצלים את סדירות הרטט של הגביש כדי לקבל אות זמן סטנדרטי, ומיקרו-מעבד מחשב את הזמן ושולט בתנועת הידיים.
דיוק מבחינת דיוק, שעוני קוורץ עדיפים על שעונים מכניים. מכיוון שתדירות התנודות של גביש קוורץ היא מאוד יציבה ופחות מושפעת מטמפרטורה ולחץ, השגיאה של שעון קוורץ קטנה מאוד, בדרך כלל אינה עולה על מספר שניות ליום. שעונים מכניים, לעומת זאת, מושפעים מגורמים רבים, כגון טמפרטורה, שינויים במיקום והמתח של הקפיץ הראשי, וכתוצאה מכך שגיאה גדולה יותר, הנעה בדרך כלל בין כמה שניות לעשרות שניות ביום.
תחזוקה גם שיטות התחזוקה של שעוני קוורץ מכניים וקוורץ שונות באופן משמעותי. שעונים מכניים דורשים פיתול תכוף ותחזוקה שוטפת בחנויות תיקונים מקצועיות כדי להבטיח דיוק ותוחלת חיים. שעוני קוורץ, לעומת זאת, אינם דורשים סלילה; יש צורך רק בהחלפת סוללה, ואורך החיים שלהם ארוך משמעותית מזה של שעונים מכניים.
עיצוב מלבד ההבדלים המהותיים בעקרונות העבודה, הדיוק והתחזוקה, שעונים מכניים וקוורץ שונים מאוד גם בעיצובם. שעונים מכניים הם בדרך כלל עבים וכבדים יותר, עם רכיבים פנימיים רבים, המגבילים את הגמישות בעיצוב החוגה. שעוני קוורץ, עם התנועות הקטנות יותר, מציעים גמישות רבה יותר בעיצוב החוגה, ומאפשרים מגוון רחב יותר של סגנונות.
